Sinds de dood van haar ouders leeft Kaoru alleen in de Kamiya Dojo, waar kenjutsu (zwaardvechttechnieken) wordt onderwezen. 10 jaar na de revolutie duikt de naam Hitokiri Battousai weer op en worden er weer moorden gepleegd onder zijn naam. Dit keer schreeuwt de moordenaar uit dat hij een meester is in de Kamiya Kashin Ryu ("het zwaard dat beschermt"), de vechtstijl van de Kamiya Dojo. Om de naam van haar familie te zuiveren gaat Kaoru de confrontatie met deze zogenaamde Hitokiri Battousai aan. Tijdend dit gevecht wordt ze gered door Kenshin, een geheimzinnige Rurouni (vergelijkbaar met een ronin, samoerai zonder meester, behalve dat Kenshin geen samoerai was, maar een huurmoordenaar).
Hiruma Gohei, de man die zich uitgeeft voor Hitokiri Battousai, is een ex-leerling van Kaoru's vader in de Kamiya Dojo. Omdat hij zwaarden zag als moordwapens werd hij verbannen en zint hij op wraak door de naam van Kamiya door het slijk te halen. Op een nacht wil hij het laatste levende lid van de Kamiya familie, namelijk Kaoru, vermoorden om zo zijn wraak compleet te maken. Op het moment dat hij zijn zwaard trekt duikt de geheimzinnige Rurouni Kenshin weer op. Hij maakt zichzelf bekend als de echte Hitokiri Battousai en verslaat Hiruma Gohei en zijn handlangers in een gevecht. Als dank biedt Kaoru hem onderdak aan in de Dojo. Kenshin aanvaard de uitnodiging en blijft bij Kaoru.
Nu gaat hij door het leven met z'n vrienden Kamiya Kaoru, Sagara Sanosuke en Miyoujin Yahiko, en strijden samen tegen ieder die de vrede willen verstoren.
Kenshin, die wroeging heeft van zijn daden als Hitokiri, heeft uit eer voor zijn slachtoffers gezworen nooit meer iemand te doden. Sinds de revolutie draagt hij een Sakabato, "gedraaid zwaard".
